زمینه های فعالیت این بخش به شرح زیر می باشد:
• به گل نشاندن واریته های مختلف نیشکر در شرایط کنترل شده و نیز به منظور انجام تلاقی بین والدین انتخابی نیشکر و تولید ژنوتیپ های جدید
• تولید بذر حقیقی نیشکر از طریق تلاقی های دلخواه و سپس کشت و انتقال نهال های تولید شده از گلخانه و قطعات کنترل شده به مزارغ تجاری نیشکر جهت ادامه مراحل مختلف اصلاحی
• اتنخاب کلون های برتر از نظر میزان درصد قند در نی، عملکرد در واحد سطح، مقاومت به آفات و بیماری ها، کمی فیبر ساقه و درجه زود رسی در مراحل مختلف سلکسیون
• برنامه ریزی جهت استفاده از بیوتکنولوژی جهت تولید پایه های سالم نیشکر و نیز تکثیر سریع ارقام برتر